当前位置： 首页 > news >正文 网站建设logo尺寸什么网站招聘外国人做兼职 news 2025/10/22 10:36:59 网站建设logo尺寸,什么网站招聘外国人做兼职,医院网站建设的目的,安徽苏亚建设安装有限公司网站大家好#xff0c;这里是专注表观组学十余年#xff0c;领跑多组学科研服务的易基因。2023年02月22日#xff0c;《美国国家科学院院刊》(Proc Natl Acad Sci USA)期刊发表了题为“Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and neurodegeneration is lin…大家好这里是专注表观组学十余年领跑多组学科研服务的易基因。2023年02月22日《美国国家科学院院刊》(Proc Natl Acad Sci USA)期刊发表了题为“Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and neurodegeneration is linked to changes in synaptic transcripts”的研究论文该研究通过对小鼠和人的健康脑组织和AD阿尔茨海默病Alzheimer’s disease患病脑组织进行MeRIP-seq、RNA-seq、MeRIP-qPCR等实验揭示m6A修饰减少与突触蛋白合成受损相关。标题Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and neurodegeneration is linked to changes in synaptic transcripts衰老和神经变性过程中m6A RNA修饰减少与突触转录本变化相关时间2023.02.22期刊Proc Natl Acad Sci USA影响因子IF 12.779技术平台MeRIP-seq、RNA-seq、MeRIP-qPCR、Polysome-seq、H3K36me3 ChIP-seq等样本实验研究摘要N6-甲基腺苷m6A调控mRNA代谢。尽管已有研究表明m6A修饰与哺乳动物大脑的发育和认知相关但m6A在突触可塑性中尤其是在认知衰退期间的作用尚未完全了解。本研究采用甲基化RNA免疫沉淀测序MeRIP-seq绘制了年轻young和老年aged小鼠海马亚区CA1、CA3和齿状回以及前扣带皮层anterior cingulate cortexACC的m6A表观转录组图谱结果表明老年小鼠的m6A水平降低。对认知完整的健康人类和阿尔茨海默病AD患者的扣带皮层CC脑组织的MeRIP-seq比较分析显示AD患者中m6A RNA甲基化水平降低。在与突触功能相关的转录本中发现老年小鼠和AD患者大脑常见的m6A变化包括钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶2CAMKII和AMPA选择性谷氨酸受体1Glua1邻近连接试验表明m6A水平降低导致突触蛋白合成如CAMKII和GLUA1减少。此外m6A水平降低还会导致突触功能受损。本研究结果表明m6A RNA甲基化调控突触蛋白合成并可能在与衰老和AD相关的认知衰退中发挥作用。研究意义本研究描述了小鼠和人类的健康和AD患病大脑中的全基因组m6A表观转录组图谱。数据分析表明大量的m6A转录本保守且这些转录本集中在突触处富集、与突触过程的调控有关。研究人员在AD小鼠模型的脑组织和患有阿尔茨海默病患者的扣带回脑组织中检测到m6A RNA甲基化水平降低。本研究在机制水平上证明了m6A修饰减少与受损的突触蛋白合成相关。结果图形1成年小鼠大脑中的m6A图谱本研究通过表征健康成年小鼠大脑中m6A RNA修饰图谱来开始分析。提取并解剖了十只C57BL/6J3月龄young野生型WT小鼠的大脑以获得海马亚区CA1、CA3和齿状回DG以及前扣带皮层ACC实验所用样本与学习和记忆过程以及认知疾病有关。对样本进行甲基化RNA免疫沉淀测序MeRIP-seq以鉴定年轻成年小鼠的亚区域特异性表观转录组图谱。图1成年小鼠大脑的m6A RNA甲基化图谱。实验方案。上根据input计算海马CA1、CA3和DG区域中m6A甲基化转录本百分比饼图。下注释的转录区域的m6A peaks位点。百分比由m6A peaks总数计算。海马亚区mRNA上m6A peaks分布吉他图。海马亚区m6A甲基化转录本Venn图。所有海马区域中检测到的m6A甲基化转录本GO富集分析上在ACC转录组中m6A RNA甲基化的分布。下注释的转录本区域的m6A peaks位点。ACC中mRNA的m6A peaks分布吉他图比较海马和ACC中m6A常见甲基化转录本Venn图。海马和ACC中常见m6A甲基化转录本中突触特异性GO富集分析Sunburst图。从海马突触体或从微流体室microfluid chamber中分离突触中获得的RNA-seq数据集中m6A甲基化转录本百分比饼图。ACC-前扣带皮层DG-齿状回5‘UTR-5非翻译区3’UTR-3非翻译区CDS-编码序列ncRNA-非编码RNA。这些数据表明常见的m6A转录本可能在突触处特异性富集为了进一步深入研究作者利用最近发表的包含高可信度的海马突触RNAome数据集并将其与海马表观转录组数据进行比较分析。在这两个数据集中观察到突触在mRNA中甲基化转录本中的强富集超过70%的突触体和64%的微流体室转录组中至少有一个m6A peaks。基于本研究数据列表与其他数据库的交叉比较分析表明m6A RNA修饰是成年大脑突触功能的关键调控过程。2成年人脑中的m6A甲基化修饰揭示了与突触功能相关的转录本保守富集接下来作者对5个死后认知未衰退健康人脑的扣带皮层CC组织进行MeRIP-seq以描绘人脑转录本中的m6A分布。图2小鼠和人之间保守的m6A修饰。上根据input计算人CC中m6A甲基化转录本百分比饼图。下图注释的转录区域m6A peaks位点。人CC中mRNA上m6A修饰分布吉他图m6A peaks的motif分析鉴定出m6A DRACH共有motifDA、T或GRA或GHA、T或C。左分别在人/小鼠中已知同源物的小鼠/人基因Doughnut图用于比较不同物种的甲基化转录本。右比较成年小鼠ACC和人CC中m6A甲基化同源转录本的Venn图。小鼠ACC和人CC共有m6A甲基化转录本的GO分析生物学过程。小鼠ACC和人CC共有m6A甲基化转录本GO富集分析的突触特异性Sunburst图。在小鼠ACC和人CCCAMKIIb/CAMKIIb中的Camk2b沿同源转录本3端保守的m6A修饰代表性覆盖轨迹。轨迹根据相应input和文库大小归一化的m6A RIP覆盖值。以RPM为单位刻度。人CC特异性m6A甲基化转录本的GO分析。与突触RNA相比保守转录本通常在小鼠和人类中检测到与人和小鼠特异性转录本之间相关联的优势比热图。色标表示富集数值比值比橙色数字对应于相应重叠P值括号中的数字表示重叠基因数量。N.S.不重要SC在微流体室的突触室中检测到的RNASyn在突触体中检测到的RNA。随机对应于2000个随机选择的大脑表达人类基因。ACC-前扣带皮层CC-扣带皮层。3小鼠认知衰退模型和人类AD患者脑组织中的m6A RNA变化通过MeRIP-seq数据证明了通过m6A修饰调控突触组织、功能和可塑性可能是成年哺乳动物大脑中的保守机制。为了进一步探索这一点作者选择鼠年龄相关记忆障碍作为认知衰退模型系统研究了m6A修饰变化机制。图3老年小鼠大脑中的组织特异性m6A变化实验方案。在相应的脑亚区中检测到的差异表达和差异甲基化基因数量条形图对FC和调整后的P值应用相同的截止值FC1.2padj≤0.05。在分析的大脑亚区中m6A甲基化转录本百分比饼图其中包含在衰老过程中仅甲基化水平降低低甲基化和仅甲基化水平增加高甲基化的peaks或m6A peaks减少和增加混合的混合peaks。所研究大脑区域转录本中显著低甲基化m6A peaks的注释分布条形图。比较海马亚区和ACC的低甲基化转录本Venn图。深红色矩形表示在所有海马亚区检测到的87个转录本。相应的右/上图显示了这些转录本的GO富集分析生物过程。黑色矩形表示海马和ACC中通常低甲基化的33个转录本右/下图显示了相应的GO富集分析。两个差异甲基化基因低甲基化和高甲基化的qPCR验证。图中显示了MeRIP-seq和MeRIP–qPCR检测到的甲基化FC。MeRIP-seq数据列表显示了FDR的平均FC由ExomePeak计算。MeRIP-qPCR数据列表显示了每个条件四个独立重复的平均值±SEM。统计显著性由Students t检验确定P值显示在比较值上方。图4表观转录组学在神经变性和衰老中的变化。AD组与对照组样品中差异表达和差异m6A甲基化转录本数量条形图对FC和调整后的P值应用相同的截止值FC1.2padj≤0.05。与对照组相比AD样本中低甲基化、高甲基化和混合转录本的比例饼图。与对照组相比AD中m6A低甲基化转录本FC1.5的GO富集分析。AD中低甲基化转录本m6A peaks分布条形图。比较老年小鼠ACC和人AD患者CC中显著低甲基化转录本Venn图突出显示的是CaMKII亚型。KEGG通路LTP图hsa04720。紫色突出显示的是AD患者的老年小鼠ACC和人CC中通常低甲基化的转录本。CAMKII也属于该组但由于其低甲基化通过qPCRH验证因此以红色突出显示。在年轻与老年小鼠、健康对照与AD患者中的人CC大脑中CamkII亚型的m6A低甲基化条形图。每条代表最接近终止密码子的相应转录本的3‘UTR中的甲基化位点。qPCR验证不同CamkII亚型的3‘UTR中低甲基化区域。图中显示通过MeRIP-seq和MeRIP-qPCR检测的m6A甲基化中的FC。误差条显示6/4young/aged独立重复的平均值±SEMP值显示在比较上方。统计显着性通过Students t检验和Welch对不等方差的校正进行评估。4m6A水平降低影响可塑相关蛋白CAMKII的合成图5m6A水平变化影响CAMKII突触蛋白合成用靶向Mettl3Mettl3 KD或相应对照寡核苷酸对照的GAPmer处理神经元培养物中Mettl3表达的qPCR结果条形图。代表性的immunoblot分析显示METTL3蛋白水平响应于GAPmer介导的METTL3敲除。B的量化。GAPmer介导的Mettl3敲除后的主要m6A水平。A、C和D中的图表显示了每个条件的平均值±SEM。每个数据点代表一个独立的复制。用于量化原代神经元中CAMKII合成的puro-PLA标记示意图。用对照或Mettl3 KD GAPmers处理的原代海马神经元的代表性图像。比例尺20μmCAMKII-PLA信号显示为绿色SYP显示为红色Map2显示为蓝色。右图显示了代表性树突的高倍图像比例尺10μm。箭头表示突触附近的CAMKII合成位点。处理的神经元中检测到的PLA点总数的Violin图。阴性对照NegC在PLA前未经嘌呤霉素处理。比较对照和Mettl3 KD处理的神经元中突触定位的CAMKII-PLA点的Violin图。G和H中的图显示三个独立实验的平均值每个实验对7-13个神经元进行成像和分析。四分位数用灰线标记。微流体室中生长的原代神经元突触室中归一化CAMKIIa mRNA水平。I中的点代表神经元培养体的独立重复。总结本研究通过MeRIP-seq等实验阐明了m6A RNA修饰在年轻和老年小鼠大脑以及认知完整的人类和AD患者大脑中的功能为该领域的进一步研究提供了重要资源。由于在大脑衰老和AD中观察到突触基因的m6A RNA甲基化降低因此靶向m6A RNA甲基化机制可能是预防认知衰退的颇具前景的策略。关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA结合高通量测序可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量总RNA起始量可降低至10μg最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域可应用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测。大样本量m6A-QTL性状关联分析传统MeRIP单个样品价格高通常难以承担。易基因开发建立MeRIP-seq2技术显著提成IP平行性实现不同样本间相对定量降低检测成本。易基因提供适用于不同科研需求的MeRIP技术m6A甲基化-常量mRNA 甲基化测序MeRIP-seqm6A甲基化-常量mRNA lncRNA甲基化测序lnc-MeRIP-seqm6A甲基化-微量mRNA lncRNA甲基化测序Micro-lnc-MeRIP-seq高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序MeRIP-seq2技术优势起始量低样本起始量可降低至10-20μg最低仅需1μg总RNA转录组范围内可以同时检测mRNA和lncRNA样本要求可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测重复性高IP富集重复性高最大化降低抗体富集偏差应用范围广广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症的发生与发展、药物应答等研究领域。研究方向m6A甲基化目前主要运用在分子机制的理论性研究疾病发生发展肿瘤、代谢疾病如肥胖/糖尿病、神经和精神疾病如阿尔兹海默症/抑郁症、炎症…发育和分化早期胚胎发育、个体/组织/器官生长发育、干细胞分化与命运决定、衰老环境暴露与响应污染、抗逆、生活方式关于m6A甲基化研究思路1整体把握m6A甲基化图谱特征m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析2筛选具体差异m6A peak和基因差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示3m6A甲基化组学转录组学关联分析Meta genes整体关联、DMG-DEG对应关联、m6A修饰目标基因的筛选策略4进一步验证或后期试验易基因科技提供全面的RNA甲基化研究整体解决方案技术详情了解请致电易基因。参考文献Castro-Hernández R,et al. Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and neurodegeneration is linked to changes in synaptic transcripts. Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Feb 28;120(9):e2204933120.相关阅读项目文章 | 90天见刊易基因m6A RNA甲基化(MeRIP)转录组组学研究干货m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析项目集锦 | 易基因近期m6A甲基化MeRIP-seq研究成果技术推介RNA m⁶A甲基化测序(MeRIP-seq)技术介绍 文章转载自： http://www.morning.rxlck.cn.gov.cn.rxlck.cn http://www.morning.xjkr.cn.gov.cn.xjkr.cn http://www.morning.jkcnq.cn.gov.cn.jkcnq.cn http://www.morning.tbkqs.cn.gov.cn.tbkqs.cn http://www.morning.cgstn.cn.gov.cn.cgstn.cn http://www.morning.guangda11.cn.gov.cn.guangda11.cn http://www.morning.bgpb.cn.gov.cn.bgpb.cn http://www.morning.nrddx.com.gov.cn.nrddx.com http://www.morning.xnqwk.cn.gov.cn.xnqwk.cn http://www.morning.pxjp.cn.gov.cn.pxjp.cn http://www.morning.qnypp.cn.gov.cn.qnypp.cn http://www.morning.lwlnw.cn.gov.cn.lwlnw.cn http://www.morning.jtnph.cn.gov.cn.jtnph.cn http://www.morning.ljfjm.cn.gov.cn.ljfjm.cn http://www.morning.kdnrc.cn.gov.cn.kdnrc.cn http://www.morning.zpqbh.cn.gov.cn.zpqbh.cn http://www.morning.nlgnk.cn.gov.cn.nlgnk.cn http://www.morning.dyhlm.cn.gov.cn.dyhlm.cn http://www.morning.tbjb.cn.gov.cn.tbjb.cn http://www.morning.ykrkq.cn.gov.cn.ykrkq.cn http://www.morning.qcygd.cn.gov.cn.qcygd.cn http://www.morning.srbl.cn.gov.cn.srbl.cn http://www.morning.kgnrh.cn.gov.cn.kgnrh.cn http://www.morning.bpds.cn.gov.cn.bpds.cn http://www.morning.wzyfk.cn.gov.cn.wzyfk.cn http://www.morning.qjbxt.cn.gov.cn.qjbxt.cn http://www.morning.qtnmp.cn.gov.cn.qtnmp.cn http://www.morning.xjnw.cn.gov.cn.xjnw.cn http://www.morning.fpyll.cn.gov.cn.fpyll.cn http://www.morning.hgscb.cn.gov.cn.hgscb.cn http://www.morning.gftnx.cn.gov.cn.gftnx.cn http://www.morning.pmsl.cn.gov.cn.pmsl.cn http://www.morning.xbckm.cn.gov.cn.xbckm.cn http://www.morning.mcjyair.com.gov.cn.mcjyair.com http://www.morning.pkrb.cn.gov.cn.pkrb.cn http://www.morning.kxqpm.cn.gov.cn.kxqpm.cn http://www.morning.kbdrq.cn.gov.cn.kbdrq.cn http://www.morning.ghpld.cn.gov.cn.ghpld.cn http://www.morning.zrks.cn.gov.cn.zrks.cn http://www.morning.qnbgk.cn.gov.cn.qnbgk.cn http://www.morning.aa1585.com.gov.cn.aa1585.com http://www.morning.zhghd.cn.gov.cn.zhghd.cn http://www.morning.zcmpk.cn.gov.cn.zcmpk.cn http://www.morning.yhplt.cn.gov.cn.yhplt.cn http://www.morning.nccqs.cn.gov.cn.nccqs.cn http://www.morning.qyxnf.cn.gov.cn.qyxnf.cn http://www.morning.zdgp.cn.gov.cn.zdgp.cn http://www.morning.wklrz.cn.gov.cn.wklrz.cn http://www.morning.jnbsx.cn.gov.cn.jnbsx.cn http://www.morning.xjnw.cn.gov.cn.xjnw.cn http://www.morning.ymwcs.cn.gov.cn.ymwcs.cn http://www.morning.smqjl.cn.gov.cn.smqjl.cn http://www.morning.pndw.cn.gov.cn.pndw.cn http://www.morning.qyfqx.cn.gov.cn.qyfqx.cn http://www.morning.mllmm.cn.gov.cn.mllmm.cn http://www.morning.txfzt.cn.gov.cn.txfzt.cn http://www.morning.przc.cn.gov.cn.przc.cn http://www.morning.mftzm.cn.gov.cn.mftzm.cn http://www.morning.rrpsw.cn.gov.cn.rrpsw.cn http://www.morning.plchy.cn.gov.cn.plchy.cn http://www.morning.mcpdn.cn.gov.cn.mcpdn.cn http://www.morning.bzkgn.cn.gov.cn.bzkgn.cn http://www.morning.kzcz.cn.gov.cn.kzcz.cn http://www.morning.srgyj.cn.gov.cn.srgyj.cn http://www.morning.zfqdt.cn.gov.cn.zfqdt.cn http://www.morning.gypcr.cn.gov.cn.gypcr.cn http://www.morning.shnqh.cn.gov.cn.shnqh.cn http://www.morning.xnqjs.cn.gov.cn.xnqjs.cn http://www.morning.hyryq.cn.gov.cn.hyryq.cn http://www.morning.daidudu.com.gov.cn.daidudu.com http://www.morning.dljujia.com.gov.cn.dljujia.com http://www.morning.pyncm.cn.gov.cn.pyncm.cn http://www.morning.pwmpn.cn.gov.cn.pwmpn.cn http://www.morning.kwqcy.cn.gov.cn.kwqcy.cn http://www.morning.jggr.cn.gov.cn.jggr.cn http://www.morning.huihuangwh.cn.gov.cn.huihuangwh.cn http://www.morning.yrjfb.cn.gov.cn.yrjfb.cn http://www.morning.gbfzy.cn.gov.cn.gbfzy.cn http://www.morning.duqianw.com.gov.cn.duqianw.com http://www.morning.qgmbx.cn.gov.cn.qgmbx.cn 查看全文 http://www.tj-hxxt.cn/news/239446.html 相关文章： 阳江市网站建设中山企业建网站 西安网站托管公司招聘政务网站的建设原则 电子商务网站建设与维护总结网站制作的费用 wordpress大前端dux5.2珠海网站设计网络优化 德阳网站seo江西省上饶市建设局网站 南京市城市建设档案馆网站怎么寻找做有意做网站的客户 网站群建设报价禁止wordpress保存修订版 网站页面结构网站建设财务上怎么处理 哪些网站的做的好看的小红书推广在哪里 网站定制开发微信运营鹤壁市建设工程交易中心网站 做网站来钱快制定 网站改版优化方案 晋中营销型网站建设网页界面设计要根据谁的色彩心理进行合理的配色 12网站免费建站宛城区网站推广 网站 单页前端开发和后端开发哪个好些 discuz修改网站关键词菜单栏颜色wordpress 怎么免费制作一个网站wordpress两侧有空白 个人网站 域名选择怎么删除网站的死链 wordpress搭建实时聊天网站谁家做电商商城网站便宜 网站建设费用预算表、简易制作网站 品牌型网站制服务器安全卫士 iis网页提示网站建设中网站开发用什么写得比较好 网站建设设计大作业创意设计网 网站建设 产品拍照如何制作网页表格 网站建设经费方案产品营销类网站 中企动力做网站 知乎wordpress能自己编码么 怀化同城网站谷歌字体wordpress 濮阳网站公司看广告赚钱 html静态页面怎么放在网站上福建省漳州市建设局网站 免费网页空间2023安徽seo网络推广 淘宝客网站备案外链工厂
