当前位置： 首页 > news >正文 免费奖励代码网站苍南具城乡建设局网站 news 2025/11/2 12:44:51 免费奖励代码网站,苍南具城乡建设局网站,网站建设网页设计小江,中国建筑集团有限公司官网招标网GEO生信数据挖掘#xff08;十#xff09;肺结核数据-差异分析-WGCNA分析#xff08;900行代码整理注释更新版本#xff09; 通过 前面十篇文章的学习#xff0c;我们应该已经可以获取到一个”心仪的基因列表“了#xff0c;相较于原始基因数量#xff0c;这个列表的数…GEO生信数据挖掘十肺结核数据-差异分析-WGCNA分析900行代码整理注释更新版本 通过 前面十篇文章的学习我们应该已经可以获取到一个”心仪的基因列表“了相较于原始基因数量这个列表的数量已经有了明显的缩小为了进一步确定Hub gene 需要借助两个工具。 使用STRING在线数据库进行PPI分析。 使用Cytoscape本地客户端进行蛋白互作关系图绘制。 STRING在线数据库进行PPI分析 https://cn.string-db.org/ STRING在线数据库STRING: functional protein association networkshttps://cn.string-db.org/ 准备好自己感兴趣的gene list 整个这列复制一下STRING也支持导入文件。 STRING 操作第一步界面 看图有操作说明 也可以选择自动auto-select数量多的话点击SEARCH后第二步也会提示选择物种。 第二步的界面 可以看看基因没问题点击CONTINUE 第三步界面 出现结果 一般会用到 Settings 和Exports Setting设置看图调整完毕后点击UPDATE更新结果。 结果导出 用Cytoscape自己调整图 导出TSV数据文件 使用Cytoscape本地客户端进行蛋白互作关系图绘制 TSV文件已经从STRING数据库中下载保存完毕。 安装Cytoscape 需要配置java环境 不同版本对应的java版本有要去本文使用Cytoscape3.10jdk-17_windows-x64_bin总计369M的压缩包链接: https://pan.baidu.com/s/19gjKs9w6TM2ylXxupA5ykw?pwd4p7y 提取码: 4p7y 复制这段内容后打开百度网盘手机App操作更方便哦 如果觉得百度盘慢评论区留下邮箱私发。 打开Cytoscape的界面 导入文件 设置列 初步图形生成 先删除孤立节点可以配合Ctrl 键进行操作 首先进行数据网络分析 选中数据Toolanalyze Network 可以再次观察下方的数据区域Node Table增加很多信息我们最关心的是degree列degree数据列值越大那么说明对应基因越重要有更多的基因连接到了目标基因。 基因样式设置 style - shape - 圆形 设置圆形的样式并勾选锁定节点的长宽 节点的大小设置 让节点的大小和degree 关联起来。 观察TP53基因大小明显改变且是最大的。 节点的形状太小把size 的下限提高。 节点的颜色设置 让节点的颜色和degree 关联起来。 设置Fill Color degre越大则颜色越深反之则越浅。设置方法同理 基因选择 可以鼠标选择图中的节点配合快捷键 还可以在Node Table 列表中进行选择基因名称然后右击鼠标功能菜单中选择图中的节点。 基因节点的排列样式 目前节点已经设置完毕边可以根据需要继续设置方法类似。 现在图形的样式排布比较随意可以将节点按照环形或者方形进行排列。 Layout -Grid layout 可以选择部分节点也可以直接对所有节点进行操作。 设置环形结构 复杂的环形结构排列 上面形状有了但是由于本例中节点的数量的太多还可以继续美化。 选择degree前10个基因先绘制一个圆形再绘制其他基因。可以迭代多个圆形。 选择了三组degree 分段后的基因生成了三个圆形下面进行排列 使用 Layout Tool 进行图形排列 打开layout Tool 调整scale 放大缩小可以调整圆环的距离。 如果缩小至最测了,仍然需要缩小可以点击重置比例。比例又会回到1。 最终调整完毕 导出文件 可以导出session项目文件后续可以继续编辑可以导出图片再论文中使用。 以上绘图共做就完成了SCI 指日可待。 文章转载自： http://www.morning.ghyfm.cn.gov.cn.ghyfm.cn http://www.morning.bzkgn.cn.gov.cn.bzkgn.cn http://www.morning.xyyplp.cn.gov.cn.xyyplp.cn http://www.morning.ftmzy.cn.gov.cn.ftmzy.cn http://www.morning.rqsnl.cn.gov.cn.rqsnl.cn http://www.morning.nspzy.cn.gov.cn.nspzy.cn http://www.morning.jkcpl.cn.gov.cn.jkcpl.cn http://www.morning.rmyt.cn.gov.cn.rmyt.cn http://www.morning.jngdh.cn.gov.cn.jngdh.cn http://www.morning.mcjxq.cn.gov.cn.mcjxq.cn http://www.morning.cnyqj.cn.gov.cn.cnyqj.cn http://www.morning.sjgsh.cn.gov.cn.sjgsh.cn http://www.morning.bwrbm.cn.gov.cn.bwrbm.cn http://www.morning.zrfwz.cn.gov.cn.zrfwz.cn http://www.morning.kxbry.cn.gov.cn.kxbry.cn http://www.morning.nrmyj.cn.gov.cn.nrmyj.cn http://www.morning.rwbh.cn.gov.cn.rwbh.cn http://www.morning.mttqp.cn.gov.cn.mttqp.cn http://www.morning.mtqqx.cn.gov.cn.mtqqx.cn http://www.morning.sskhm.cn.gov.cn.sskhm.cn http://www.morning.tqbw.cn.gov.cn.tqbw.cn http://www.morning.ghxzd.cn.gov.cn.ghxzd.cn http://www.morning.mdpcz.cn.gov.cn.mdpcz.cn http://www.morning.qxkcx.cn.gov.cn.qxkcx.cn http://www.morning.cmrfl.cn.gov.cn.cmrfl.cn http://www.morning.zlxkp.cn.gov.cn.zlxkp.cn http://www.morning.mkzdp.cn.gov.cn.mkzdp.cn http://www.morning.xxzjb.cn.gov.cn.xxzjb.cn http://www.morning.gpryk.cn.gov.cn.gpryk.cn http://www.morning.nccyc.cn.gov.cn.nccyc.cn http://www.morning.xpqyf.cn.gov.cn.xpqyf.cn http://www.morning.prprz.cn.gov.cn.prprz.cn http://www.morning.yrmgh.cn.gov.cn.yrmgh.cn http://www.morning.nkddq.cn.gov.cn.nkddq.cn http://www.morning.bpds.cn.gov.cn.bpds.cn http://www.morning.prlgn.cn.gov.cn.prlgn.cn http://www.morning.mkfhx.cn.gov.cn.mkfhx.cn http://www.morning.xlclj.cn.gov.cn.xlclj.cn http://www.morning.cyysq.cn.gov.cn.cyysq.cn http://www.morning.hrnrx.cn.gov.cn.hrnrx.cn http://www.morning.hxcrd.cn.gov.cn.hxcrd.cn http://www.morning.c7623.cn.gov.cn.c7623.cn http://www.morning.bwqcx.cn.gov.cn.bwqcx.cn http://www.morning.kkwbw.cn.gov.cn.kkwbw.cn http://www.morning.ssgqc.cn.gov.cn.ssgqc.cn http://www.morning.tpkxs.cn.gov.cn.tpkxs.cn http://www.morning.stprd.cn.gov.cn.stprd.cn http://www.morning.rgxf.cn.gov.cn.rgxf.cn http://www.morning.clpdm.cn.gov.cn.clpdm.cn http://www.morning.zpzys.cn.gov.cn.zpzys.cn http://www.morning.mmqng.cn.gov.cn.mmqng.cn http://www.morning.qqhmg.cn.gov.cn.qqhmg.cn http://www.morning.cfcdr.cn.gov.cn.cfcdr.cn http://www.morning.kbgzj.cn.gov.cn.kbgzj.cn http://www.morning.bgrsr.cn.gov.cn.bgrsr.cn http://www.morning.qlwfz.cn.gov.cn.qlwfz.cn http://www.morning.gfjgq.cn.gov.cn.gfjgq.cn http://www.morning.txysr.cn.gov.cn.txysr.cn http://www.morning.rwqj.cn.gov.cn.rwqj.cn http://www.morning.darwallet.cn.gov.cn.darwallet.cn http://www.morning.wtcbl.cn.gov.cn.wtcbl.cn http://www.morning.drcnf.cn.gov.cn.drcnf.cn http://www.morning.qnlbb.cn.gov.cn.qnlbb.cn http://www.morning.rmyqj.cn.gov.cn.rmyqj.cn http://www.morning.qmbgb.cn.gov.cn.qmbgb.cn http://www.morning.rbkl.cn.gov.cn.rbkl.cn http://www.morning.txlnd.cn.gov.cn.txlnd.cn http://www.morning.jgcyn.cn.gov.cn.jgcyn.cn http://www.morning.xfyjn.cn.gov.cn.xfyjn.cn http://www.morning.rbknf.cn.gov.cn.rbknf.cn http://www.morning.drcnf.cn.gov.cn.drcnf.cn http://www.morning.pfggj.cn.gov.cn.pfggj.cn http://www.morning.cwyfs.cn.gov.cn.cwyfs.cn http://www.morning.pypbz.cn.gov.cn.pypbz.cn http://www.morning.jqtb.cn.gov.cn.jqtb.cn http://www.morning.drzkk.cn.gov.cn.drzkk.cn http://www.morning.hmqjj.cn.gov.cn.hmqjj.cn http://www.morning.fcxt.cn.gov.cn.fcxt.cn http://www.morning.csnmd.cn.gov.cn.csnmd.cn http://www.morning.xckdn.cn.gov.cn.xckdn.cn 查看全文 http://www.tj-hxxt.cn/news/270903.html 相关文章： 代挂网站维护wordpress模板引擎 wordpress关闭站点wordpress 3.3.1漏洞 网站数字化建设中国建设银行门户网站企业 网站管理员登陆不了亚马逊跨境电商能赚钱吗 网站企业建设公司排名企业招聘网站模板 网站开发和设计如何合作工图网 微信上的网站怎么做的吗摄影网站开发的意义 新蔡县住房和城乡建设局网站做网站模板平台 小程序公众号网站开发朝阳区搜索优化seosem 网站开发的目的及意义网站开发主要任务 怎么自己做网站加盟wordpress大括号 网站怎么营销推广做外贸无法登录国外网站怎么办 南京做企业网站公司seo教程最新 什么网站建设策划方案 论文网站空间多久续一次费 溧水区城乡建设局网站产品软文 cps广告联盟网站2024房地产趋势分析 四川微信网站建设推广北京网站关键词 外贸网站推广渠道国外视频模板网站e 子页网站设计捷克网站后缀 网站搭建上门多少钱永嘉网站开发公司 gps定位网站建设响应式网站和普通网站不同 自己建个购物网站html网页设计代码及素材 网站建设基础wordpress cms怎么登陆界面 社区网站制作360度全景街景地图 网站设计实训心得长春做网站优化 济宁恒德建设有限公司网站dedecms中英文网站开发 商业计划书网站建设wordpress 首页链接 西部数码的vps云主机如何访问网站长春市网站推广 金华网站建设大型网页建设企业网站用vps还是虚拟主机 zzcms网站开发视频直播sdk
