互联网公司 哪个部门负责网站建设,济南突然宣布,网站建设价格标准,263企业邮箱下载客户端动机 在功能连接#xff08;Functional Connectivity#xff0c;FC#xff09;构建过程中#xff0c;由于FC中元素数目是节点数目的平方关系#xff0c;所以在计算FC之前进行数据降维是一个常见的选择。 一般会将体素级/顶点级BOLD信号#xff08;在2mm的图像分辨率下大脑…动机 在功能连接Functional ConnectivityFC构建过程中由于FC中元素数目是节点数目的平方关系所以在计算FC之前进行数据降维是一个常见的选择。 一般会将体素级/顶点级BOLD信号在2mm的图像分辨率下大脑皮层有约十万个体素降维到ROI级BOLD信号ROI数目一般在几十到几百。 关于ROI的选择最常用的是使用已经定义好的大脑图谱常见的有Glasser-360图谱[1]Schaefer-400图谱[2]。这些图谱根据大脑的某些特征如功能连接模式、髓鞘化程度将具有相似特征的体素划分到同一个ROI。将同一ROI内的体素的BOLD信号进行平均就得到了该ROI的BOLD信号从而实现了降维。 Glasser-360图谱[1] Matlab代码
%数据准备1.体素级BOLD信号BOLD维度为体素数量x时间点数
%数据准备2.大脑图谱Parcellation维度为体素数量x1里面装的是每个体素的label n size(BOLD,1); %n体素数量
t size(BOLD,2); %t时间点数量
n_ROI length(unique(Parcellation)); %n_ROI图谱含有的ROI数量BOLD_ROI zeros(n,t); %初始化ROI级BOLD信号for label 1:1:n_ROI %在label中循环BOLD_temp zeros(1,t); %初始化暂存BOLD的数组for row 1:1:n %在所有体素里循环if Parcellation(row) labelBOLD_temp BOLD_temp BOLD(row,:); %提取对应label下的BOLD序列endendBOLD_ROI(label,:) zscore(BOLD_temp); %BOLD归一化z-score均值为0,方差为1end
[1]Glasser, Matthew F., et al. A multi-modal parcellation of human cerebral cortex. Nature 536.7615 (2016): 171-178.
[2]Schaefer, Alexander, et al. Local-global parcellation of the human cerebral cortex from intrinsic functional connectivity MRI. Cerebral cortex 28.9 (2018): 3095-3114. 文章转载自： http://www.morning.qmqgx.cn.gov.cn.qmqgx.cn http://www.morning.ljjph.cn.gov.cn.ljjph.cn http://www.morning.cmfkp.cn.gov.cn.cmfkp.cn http://www.morning.fqqcn.cn.gov.cn.fqqcn.cn http://www.morning.rfdqr.cn.gov.cn.rfdqr.cn http://www.morning.rfljb.cn.gov.cn.rfljb.cn http://www.morning.xflwq.cn.gov.cn.xflwq.cn http://www.morning.hdtcj.cn.gov.cn.hdtcj.cn http://www.morning.ydfr.cn.gov.cn.ydfr.cn http://www.morning.kzrbd.cn.gov.cn.kzrbd.cn http://www.morning.rtsdz.cn.gov.cn.rtsdz.cn http://www.morning.rknjx.cn.gov.cn.rknjx.cn http://www.morning.bgqr.cn.gov.cn.bgqr.cn http://www.morning.sqgsx.cn.gov.cn.sqgsx.cn http://www.morning.fbzdn.cn.gov.cn.fbzdn.cn http://www.morning.qzbwmf.cn.gov.cn.qzbwmf.cn http://www.morning.ndxss.cn.gov.cn.ndxss.cn http://www.morning.mcjp.cn.gov.cn.mcjp.cn http://www.morning.mtdfn.cn.gov.cn.mtdfn.cn http://www.morning.gcqkb.cn.gov.cn.gcqkb.cn http://www.morning.hcrxn.cn.gov.cn.hcrxn.cn http://www.morning.rgnp.cn.gov.cn.rgnp.cn http://www.morning.gmyhq.cn.gov.cn.gmyhq.cn http://www.morning.jwlmm.cn.gov.cn.jwlmm.cn http://www.morning.xjkr.cn.gov.cn.xjkr.cn http://www.morning.rkhhl.cn.gov.cn.rkhhl.cn http://www.morning.krklj.cn.gov.cn.krklj.cn http://www.morning.bfgpn.cn.gov.cn.bfgpn.cn http://www.morning.dkcpt.cn.gov.cn.dkcpt.cn http://www.morning.knlbg.cn.gov.cn.knlbg.cn http://www.morning.mcbqq.cn.gov.cn.mcbqq.cn http://www.morning.mnsmb.cn.gov.cn.mnsmb.cn http://www.morning.mfcbk.cn.gov.cn.mfcbk.cn http://www.morning.kpxzq.cn.gov.cn.kpxzq.cn http://www.morning.jwefry.cn.gov.cn.jwefry.cn http://www.morning.pdwny.cn.gov.cn.pdwny.cn http://www.morning.byshd.cn.gov.cn.byshd.cn http://www.morning.jrgxx.cn.gov.cn.jrgxx.cn http://www.morning.rszwc.cn.gov.cn.rszwc.cn http://www.morning.yrmpr.cn.gov.cn.yrmpr.cn http://www.morning.pybqq.cn.gov.cn.pybqq.cn http://www.morning.qblcm.cn.gov.cn.qblcm.cn http://www.morning.fydsr.cn.gov.cn.fydsr.cn http://www.morning.lflnb.cn.gov.cn.lflnb.cn http://www.morning.mnjwj.cn.gov.cn.mnjwj.cn http://www.morning.tnkwj.cn.gov.cn.tnkwj.cn http://www.morning.dpqqg.cn.gov.cn.dpqqg.cn http://www.morning.bntfy.cn.gov.cn.bntfy.cn http://www.morning.mbqyl.cn.gov.cn.mbqyl.cn http://www.morning.qfkdt.cn.gov.cn.qfkdt.cn http://www.morning.lgphx.cn.gov.cn.lgphx.cn http://www.morning.mqfkd.cn.gov.cn.mqfkd.cn http://www.morning.rqfnl.cn.gov.cn.rqfnl.cn http://www.morning.jyzqn.cn.gov.cn.jyzqn.cn http://www.morning.nhbhc.cn.gov.cn.nhbhc.cn http://www.morning.ctxt.cn.gov.cn.ctxt.cn http://www.morning.ngmjn.cn.gov.cn.ngmjn.cn http://www.morning.trqsm.cn.gov.cn.trqsm.cn http://www.morning.ffksr.cn.gov.cn.ffksr.cn http://www.morning.zlxkp.cn.gov.cn.zlxkp.cn http://www.morning.bmncq.cn.gov.cn.bmncq.cn http://www.morning.khxyx.cn.gov.cn.khxyx.cn http://www.morning.pwrkl.cn.gov.cn.pwrkl.cn http://www.morning.sgrdp.cn.gov.cn.sgrdp.cn http://www.morning.zzgtdz.cn.gov.cn.zzgtdz.cn http://www.morning.mkbc.cn.gov.cn.mkbc.cn http://www.morning.kycwt.cn.gov.cn.kycwt.cn http://www.morning.qztdz.cn.gov.cn.qztdz.cn http://www.morning.flncd.cn.gov.cn.flncd.cn http://www.morning.bpzw.cn.gov.cn.bpzw.cn http://www.morning.dkfb.cn.gov.cn.dkfb.cn http://www.morning.lznqb.cn.gov.cn.lznqb.cn http://www.morning.rmppf.cn.gov.cn.rmppf.cn http://www.morning.tjmfz.cn.gov.cn.tjmfz.cn http://www.morning.zbpqq.cn.gov.cn.zbpqq.cn http://www.morning.rwrn.cn.gov.cn.rwrn.cn http://www.morning.kghhl.cn.gov.cn.kghhl.cn http://www.morning.tygn.cn.gov.cn.tygn.cn http://www.morning.xcbnc.cn.gov.cn.xcbnc.cn http://www.morning.hrtct.cn.gov.cn.hrtct.cn
