当前位置： 首页 > news >正文 南通物流网站建设专业网页制作网站推广公司 news 2025/10/27 20:03:35 南通物流网站建设,专业网页制作网站推广公司,微信官方网站首页,ui设计师工作流程HMMER是一个软件包#xff0c;它提供了制作蛋白质和DNA序列域家族概率模型的工具#xff0c;称为轮廓隐马尔可夫模型、轮廓HMM或仅轮廓#xff0c;并使用这些轮廓来注释新序列、搜索序列数据库以寻找其他同源物#xff0c;以及进行深度多重序列比对。HMMER是已知蛋白质和DN…HMMER是一个软件包它提供了制作蛋白质和DNA序列域家族概率模型的工具称为轮廓隐马尔可夫模型、轮廓HMM或仅轮廓并使用这些轮廓来注释新序列、搜索序列数据库以寻找其他同源物以及进行深度多重序列比对。HMMER是已知蛋白质和DNA序列域家族的几种综合比对和图谱的基础包括Pfam数据库。 网页版 https://www.ebi.ac.uk/Tools/hmmer/ conda install hmmer # 各种安装方式。http://hmmer.org/documentation.html# install_path/hmmer-3.3.2/tutorial test文件位置### 1. hmmsearch:用profile文件搜索序列数据库## Step 1: build a profile with hmmbuild# globins4.sto 四个珠蛋白序列的MSA比对结果Stockholm formathmmbuild globins4.hmm globins4.sto# 统计对序列比对MSA 的HMM隐马尔科夫 profile hmmstat globins4.hmm## Step 2: search the sequence database with hmmsearch # 下载数据库文件如 uniprot_sprot.fasta globins45.fa为演示数据库hmmsearch globins4.hmm globins45.fa globins4.out# 输出globins4.out为sequence top hits listBLAST-like style # E-value 期望的假阳性率### 2 在序列数据库中迭代搜索 jackhmmer HBB_HUMAN uniprot_sprot.fasta### 3. 用序列文件搜索profile数据库 ## Step 1: create a profile database file hmmbuild globins4.hmm globins4.sto hmmbuild fn3.hmm fn3.sto hmmbuild Pkinase.hmm Pkinase.sto cat globins4.hmm fn3.hmm Pkinase.hmm minifam## Step 2: compress and index the flatfile with hmmpress hmmpress minifam## Step 3: search the profile database with hmmscan hmmscan minifam 7LESS_DROME 参考http://eddylab.org/software/hmmer/Userguide.pdf 文章转载自： http://www.morning.pmjhm.cn.gov.cn.pmjhm.cn http://www.morning.skrh.cn.gov.cn.skrh.cn http://www.morning.kkhf.cn.gov.cn.kkhf.cn http://www.morning.phlwj.cn.gov.cn.phlwj.cn http://www.morning.mknxd.cn.gov.cn.mknxd.cn http://www.morning.qgkcs.cn.gov.cn.qgkcs.cn http://www.morning.ypklb.cn.gov.cn.ypklb.cn http://www.morning.lctrz.cn.gov.cn.lctrz.cn http://www.morning.pjwml.cn.gov.cn.pjwml.cn http://www.morning.fpjw.cn.gov.cn.fpjw.cn http://www.morning.xhgcr.cn.gov.cn.xhgcr.cn http://www.morning.rfrxt.cn.gov.cn.rfrxt.cn http://www.morning.tlnbg.cn.gov.cn.tlnbg.cn http://www.morning.yhjlg.cn.gov.cn.yhjlg.cn http://www.morning.rhmt.cn.gov.cn.rhmt.cn http://www.morning.chongzhanggui.cn.gov.cn.chongzhanggui.cn http://www.morning.jrhcp.cn.gov.cn.jrhcp.cn http://www.morning.lfcnj.cn.gov.cn.lfcnj.cn http://www.morning.nnhfz.cn.gov.cn.nnhfz.cn http://www.morning.rjynd.cn.gov.cn.rjynd.cn http://www.morning.wfjyn.cn.gov.cn.wfjyn.cn http://www.morning.yqwsd.cn.gov.cn.yqwsd.cn http://www.morning.nfqyk.cn.gov.cn.nfqyk.cn http://www.morning.smygl.cn.gov.cn.smygl.cn http://www.morning.dhmll.cn.gov.cn.dhmll.cn http://www.morning.zlgbx.cn.gov.cn.zlgbx.cn http://www.morning.brnwc.cn.gov.cn.brnwc.cn http://www.morning.pyzt.cn.gov.cn.pyzt.cn http://www.morning.jzykq.cn.gov.cn.jzykq.cn http://www.morning.jjrsk.cn.gov.cn.jjrsk.cn http://www.morning.krzrg.cn.gov.cn.krzrg.cn http://www.morning.dmtbs.cn.gov.cn.dmtbs.cn http://www.morning.hsjrk.cn.gov.cn.hsjrk.cn http://www.morning.lcxzg.cn.gov.cn.lcxzg.cn http://www.morning.rgrys.cn.gov.cn.rgrys.cn http://www.morning.drcnf.cn.gov.cn.drcnf.cn http://www.morning.fqmcc.cn.gov.cn.fqmcc.cn http://www.morning.yrcxg.cn.gov.cn.yrcxg.cn http://www.morning.tfgkq.cn.gov.cn.tfgkq.cn http://www.morning.hmpxn.cn.gov.cn.hmpxn.cn http://www.morning.jzbjx.cn.gov.cn.jzbjx.cn http://www.morning.qjngk.cn.gov.cn.qjngk.cn http://www.morning.lgwjh.cn.gov.cn.lgwjh.cn http://www.morning.cxnyg.cn.gov.cn.cxnyg.cn http://www.morning.xinxianzhi005.com.gov.cn.xinxianzhi005.com http://www.morning.tqjwx.cn.gov.cn.tqjwx.cn http://www.morning.xzsqb.cn.gov.cn.xzsqb.cn http://www.morning.lwxsy.cn.gov.cn.lwxsy.cn http://www.morning.rnngz.cn.gov.cn.rnngz.cn http://www.morning.mrskk.cn.gov.cn.mrskk.cn http://www.morning.qbzfp.cn.gov.cn.qbzfp.cn http://www.morning.bydpr.cn.gov.cn.bydpr.cn http://www.morning.sqfnx.cn.gov.cn.sqfnx.cn http://www.morning.yskhj.cn.gov.cn.yskhj.cn http://www.morning.lhytw.cn.gov.cn.lhytw.cn http://www.morning.ctswj.cn.gov.cn.ctswj.cn http://www.morning.rqgq.cn.gov.cn.rqgq.cn http://www.morning.sgrwd.cn.gov.cn.sgrwd.cn http://www.morning.ylyzk.cn.gov.cn.ylyzk.cn http://www.morning.srjbs.cn.gov.cn.srjbs.cn http://www.morning.gxhqt.cn.gov.cn.gxhqt.cn http://www.morning.rmtmk.cn.gov.cn.rmtmk.cn http://www.morning.sfzwm.cn.gov.cn.sfzwm.cn http://www.morning.dbdmr.cn.gov.cn.dbdmr.cn http://www.morning.xwbwm.cn.gov.cn.xwbwm.cn http://www.morning.qhfdl.cn.gov.cn.qhfdl.cn http://www.morning.rhfbl.cn.gov.cn.rhfbl.cn http://www.morning.mtdfn.cn.gov.cn.mtdfn.cn http://www.morning.dhyqg.cn.gov.cn.dhyqg.cn http://www.morning.nqmdc.cn.gov.cn.nqmdc.cn http://www.morning.llthz.cn.gov.cn.llthz.cn http://www.morning.qfqld.cn.gov.cn.qfqld.cn http://www.morning.jbtlf.cn.gov.cn.jbtlf.cn http://www.morning.fxkgp.cn.gov.cn.fxkgp.cn http://www.morning.sjbty.cn.gov.cn.sjbty.cn http://www.morning.snkry.cn.gov.cn.snkry.cn http://www.morning.ymqfx.cn.gov.cn.ymqfx.cn http://www.morning.rybr.cn.gov.cn.rybr.cn http://www.morning.jrlgz.cn.gov.cn.jrlgz.cn http://www.morning.rlbc.cn.gov.cn.rlbc.cn 查看全文 http://www.tj-hxxt.cn/news/254718.html 相关文章： 网站建设模板怎么设计哪里可以做网站开发 长沙的网站建设wordpress实现pdf浏览器 自己做网站 需要会什么6wordpress云 购物网站怎么做代码百度seo排名优化排行 玄武模板网站制作品牌天津公司网站建设 青岛中英网站建设中国做网站知名的公司 微信公众号开发网站开发女生wordpress网站适合 外贸建站推广多少钱外贸网站 推广 站外推广免费网站帮别的公司做网站违法吗 临清建网站百度的广告怎么免费发布 东莞设计兼职网站建设宁波网站推广网站优化 昌平最好的网站建设做家教中介 不建网站怎么做 网站优化排名云南网站推广 平顶山市湛河区建设局网站进一步加强区门户网站建设管理办法 顺德佛山做app网站返利导购网站建设需求文档 做h5的网站网站的设计与开发的图片 网站的发布与推广方式展厅公司 湘潭市高新建设局施工报建网站网站建设新际 建设网站的十个步骤广州网站设计首选柚米 站长工具高清无吗vps如何做网站步骤 《网站建设与管理》方案wordpress 竞价页 做公司网站域名怎么做记账凭证佛山网站优化 2013我国中小企业接入互联网和网站建设情况网站首页动图怎么做 住房和城乡建设部网站 事故快手极光视频小程序 网站手册网址转短链接 东莞房价排名佛山百度网站快速优化 有没有专门做帽子的网站专门做任务的网站 义乌网站制作河北邯郸房价 网站后台数据库设计上海何鹏seo 奉化市建设局网站免费wordpress中文博客主题
