做网站空间和服务器的,如何做设计网站页面设计,wordpress二次开发视频教程,一学一做看视频网站有哪些原文链接#xff1a;使用ggplot绘制柱状图#xff0c;在柱子中显示数值和显著性
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本期教程 获得本期教程示例数据后台回复关键词20240628。PS在社群中可获得往期和未来教程所有数据和代码 往期教程部分内容 写在前面
基于ggplot绘制柱状图小技巧很基础的图形。但是越到后面会发现越是基础的图形我们使用的频率越高。今天的教程是基于发芽指数来绘制我们模拟一个发芽数和天数计算出发芽指数。
代码
##在柱状图中显示数字
##2024.06.28
##
##小杜的生信笔记library(ggplot2)
library(dplyr)
library(tidyr)
library(ggplot2)
library(agricolae)setwd(D:\\BioinfoFile\\小杜的生信笔记\\2024\\20240628_柱状图中显示数据)
##此次数据基于种子发芽指数计算公式进行数据具有随机性不具有任何意义。
##加载数据
data - read.csv(20240628_inputdata.csv,header T)data相关计算代码
## 转换数据
long_data - data %%pivot_longer(cols starts_with(germinated), names_to replicate, values_to germinated)
long_data
##计算活力指数
germination_index - long_data %%group_by(treatment, day) %%summarise(GI sum(germinated / day)) %%ungroup()#计算各个处理的平均数和标准差
summary_gi - germination_index %%group_by(treatment) %%summarise(mean_GI mean(GI), sd_GI sd(GI))#单因素方差分析
anova_result - aov(GI ~ treatment day, data germination_index)
summary(anova_result)#进行Tukey HSD检验
tukey_result - HSD.test(anova_result, treatment, group TRUE)
print(tukey_result)# 提取 Tukey HSD 结果中的字母标记
groups - tukey_result$groups
df_letters - data.frame(sample rownames(groups), letters groups$groups)
##修改名称
colnames(df_letters) - c(treatment,letters)# 合并均值和字母标记
df_data - merge(summary_gi, df_letters, by treatment)绘图
ggplot(df_data, aes(x treatment, y mean_GI, fill treatment)) geom_bar(stat identity, position dodge, color black, size 0.5) ##误差线geom_errorbar(aes(ymin mean_GI - sd_GI, ymax mean_GI sd_GI), width 0.15, ## 宽度size 1 ##字体大小) ##显示数字geom_text(aes(x treatment, y mean_GI sd_GI 0.5, ## “0.5”显示的高度label round(mean_GI, 2)), ### round(mean_GI, 2)),其中2表示数字显示的小数点位数size 5,color black) ##显示显著性geom_text(aes(x treatment, y mean_GI sd_GI 1.3, label letters), size 6, color red) theme_bw()scale_fill_manual(values c(#1f78b4, #ff7f00, #4daf4a)) labs(x NULL, y Germination Index)theme(#axis.line element_line(size 1), ## 粗细textelement_text(#family sans,colour black,size 10),axis.text.x element_text(color black, size 12),axis.text.y element_text(color black,size 11),axis.ticks element_line(colour black),strip.text element_text(color black,size 10),axis.title element_text(color black,size 12), ##坐标轴字体大小legend.position none,strip.background element_blank())ggsave(20240608_柱状图-显示数字.pdf,width 6, height 4)获得本期教程示例数据后台回复关键词20240628。PS在社群中可获得往期和未来教程所有数据和代码 若我们的教程对你有所帮助请点赞收藏转发这是对我们最大的支持。 往期部分文章
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